由于南中大姓据地自雄，抵御王朝势力。南夷校尉势单力薄，难于控制南中大姓，晋廷于太安二年(公元303年)
再次在南中设置宁州。重建宁州并非简单恢复泰始时的宁州，而做了一些改进。首先是将牂牁、越嶲、朱提三郡划归宁州，其次，将建宁郡的滇池地区分离出来，建立晋宁郡。宁州就由原来统领四郡变为统领八郡。宁州的设置，是云南郡县制度发展史上的一个重要的里程碑。从此，南中从隶属于蜀的“附庸”，成为与蜀(益州)平行直属于中央王朝的一个单独的行政区划。和蜀(益州)一样，宁州(南中)也是全国十九州之一[2]。
汉晋时期在云南设置的郡县与内地郡县不同，因开始设置的时间在汉武帝时期，与原来的郡县不同，故称为“新郡”或“初郡”。因为新郡(初郡)基本上位于边疆，所以又称为“边郡”。
边郡的主要特点是：
1.边郡大都以族群(部族)连结的范围为行政区划。南中七郡，基本上是以族群的范围划分的。建宁郡以滇人为主；云南郡以昆明人为主；永昌郡以哀牢人为主；朱提郡以僰人为主；越嶲郡以叟人(邛、笮)为主；牂牁郡以夜郎为主；兴古郡以句町、进桑为主。
2.朝廷任命官员到边郡担任太守、县令、邑长，同时又委任当地族群的首领作为王、侯、长统领本部落的民众。汉武帝时设益州郡，封滇王为王，牂牁郡则委任夜郎王为侯。朝廷派遣的官员称为流官，即有任期，不断流动。当地族群的酋长首领称为土官。土官不仅终身为官，而且是世代为官(世袭制)。流官治其土，土官世其民。
3.边郡没有编户齐民，无法征收租税，故不立征调，仅只缴纳贡赋，又土长解纳方物土产为贡。
4.内地郡县的太守只管行政，不能理军务；军事由都尉(郡尉)辅佐太守(郡守)掌管。边郡的太守主管军事，统领兵丁，兵丁由内地遣戍。
边郡与内郡虽有不同的特点，但本质是一样的，同是统一多民族国家中央集权郡县制的有机组成部分。
云南边郡的建立、发展、巩固和逐步完善，使云南作为统一多民族国家的一部分不断巩固，是云南与内地的经济文化诸方面的交流在行政体制上得到保证，也就是使云南与内地的经济、政治、文化的联系成为制度定下来，为中国西南边疆的形成奠定了基础，促进了云南社会经济与文化技术的发展。
注解：
[1]《三国志·蜀志·后主传》。
[2] 19州为太康元年(公元280年)的资料。惠帝元康初年尝割荆、扬二州的一部分，别置江州。怀帝又分荆、广二州的一部分，别建相州。故西晋一代实际为21州。
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