内蒙古蒙古族青年合唱团由时任内蒙古电台音乐编辑的呼日乐发起，内蒙古广播艺术团青年作曲家色·恩克巴雅尔及其助手娅伦格日勒，汇集了内蒙古直属文艺团体和机关的合唱爱好者30多人，于1987年3月8日正式成立。团员中大多数人是蒙古族，也有汉族和达斡尔族等民族，约有一半成员来自声乐实力雄厚的内蒙古广播艺术团。

    合唱团成立之初，克服了活动经费、排练场地等方面遇到的困难，在演唱作品方面，经过多方宣传，得到了作曲家们的热情支持，征集到了由火华作词、阿拉腾奥勒作曲的歌曲《美丽的草原我的家》、辛沪光根据内蒙古东部民歌改编的《鸿嘎鲁》、《乌云格日勒》，莫尔吉胡改编的《赞歌》等30多部不同风格的、由独唱歌曲和民歌改编的，或新创作的合唱作品。

合唱团于1989年首次录制了他们演唱的《美丽的草原我的家》、《鸿嘎鲁》、《八骏赞》、《四季》等20余首歌曲。1990年，美国“华纳”唱片公司录制了该团演唱的《劝奶歌》等17首作品，选作国际交流节目，与世界60多个国家和地区的电台节目进行交流。1991年，中央人民广播电台将《鸿嘎鲁》、《八骏赞》、《四季》等合唱歌曲制作成专题节目介绍给全国听众。这样，合唱团的无伴奏合唱歌曲首次通过中央人民广播电台传播到世界各地。

1991年10月，内蒙古蒙古族青年合唱团首次应邀到北京参加“第三届北京合唱节”。在北京音乐厅，当属于原生态的草原音乐演唱形式—长调、“潮尔”和现代混声合唱基本技巧巧妙结合，蒙古族独特的“喉音”艺术—“呼麦”其特殊的气泡式的低音和金属音般清亮的高音组合成奇特的多声部效果，领唱、伴唱、无伴奏合唱、混声合唱等多种技巧娴熟自如地将蒙古族丰富多彩的民歌和创作歌曲展现出来时，成为合唱节的头彩，震撼了首都观众，引起首都新闻界的普遍关注和争相报道，音乐界也给予了很高的评价，他们的演出以最高分获得中国音乐最高奖—一等奖，指挥娅伦格日勒获得指挥奖。第三届北京合唱节之后，内蒙古蒙古族青年合唱团声名鹊起。1992年7月和1993年7月，合唱团两次应文化部、国家旅游局邀请进京参加“为了明天—和平友谊中国国际合唱节”的演出活动，与来自新加坡、泰国、日本、墨西哥以及我国台湾地区、中国中央歌舞剧院合唱团等十几个著名合唱团体同台献艺。内蒙古蒙古族青年合唱团虽然因经费不足而住在大学生宿舍，乘公共汽车赶赴演出地，但他们仍不负众望，以发自肺腑、至纯至美的高水准演唱，将来自内蒙草原的歌曲呈现给广大观众，在两次演出中大获成功，场场爆满。

1993年10月，应香港市政当局邀请，他们代表中国参加了在香港举办的“中国音乐节”演出活动。此后又应台湾爱乐文教基金会的邀请，到台北、高雄等6个城市演出。在香港和台湾，他们演唱的来自内蒙古的歌曲，像从草原上飞奔而来的插翅神骥，像在广阔天地间回荡的天籁之音，以十分奇特的艺术感染力和无比美妙的声音效果，震惊了香港民众，特别是震惊了和祖国隔绝多年、第一次聆听到来自祖国的蒙古族合唱的台湾民众。这次演出同样大受欢迎，演员们所到之处，人们夹道欢迎，很多观众甚至跟着合唱团从一个城市到另一个城市，辗转往来，连续观看合唱团的演出。

1994年6月，内蒙古蒙古族青年合唱团被选入美国表演艺术委员会的表演艺术名录册。

1996年，应联合国教科文组织世界合唱联盟的邀请，内蒙古蒙古族青年合唱团赴澳大利亚参加第四届世界合唱节。在著名的悉尼歌剧院和来自世界各地的30个著名合唱团体同台献艺。他们首次在国际合唱节上亮相，就以鲜明的蒙古族特色和和谐平衡、立体、声部统一流畅的较高演唱水准，使来自世界各地的观众强烈地感受到来自内蒙古草原合唱艺术的魅力。在演绎《草原恋》、《劝奶歌》等歌曲中，将被称为草原游牧文化基本标志的长调融合到合唱中作为领唱，利用蒙古族特有的合唱形式—“潮尔”作为低音配唱，形成混声形态，渲染烘托出歌曲内容，使得歌曲富于变化。在表现歌曲《八骏赞》时，浑厚的男声以蒙古族传统的说唱赞颂词的方法吟颂成吉思汗八匹骏马的风采，女声用多声部歌唱衬托骏马奔驰的节奏，然后以男女声对唱的方式赞美骏马，使得在表现歌曲思想内容、气氛之时，绘声绘色、多姿多彩。《美丽的草原我的家》本来是一首独唱歌曲，在用合唱表现这首著名的歌曲时，大胆进行提炼、加工，用凝重的和声，细腻、富有激情的演唱，使得歌曲在描绘草原如诗如画的风景时显得更加浑厚悠远、曲折婉转。合唱节组委破例让合唱团演出4场，结果是场场爆满。悉尼歌剧院的演出，使内蒙古蒙古族青年合唱团受到国际合唱界的关注和高度评价，赢得了巨大的国际声誉，步入世界一流合唱团行列，也使内蒙古蒙古族青年合唱团的艺术生涯达到顶峰。此后，来自世界各地的演出邀请纷至沓来。1997年11月，他们赴西班牙托罗萨市，代表中国参加欧洲最古老、最有声望的合唱比赛之一“第二十九届托罗萨国际合唱比赛”，获得比赛主调音乐铜奖。1999年，赴瑞典参加另一个著名的合唱节—“斯德哥尔摩冬季合唱节”；2000年，赴奥地利参加“第一届国际奥林匹克合唱大赛”，荣获民歌无伴奏合唱、民歌有伴奏合唱和无伴奏室内小合唱三项金牌；2001年9月17日，参加中国在德国柏林市举办的“亚太文化周”专场演出活动，再次轰动欧洲乐坛，又一次展现了中国蒙古族合唱艺术的魅力。

内蒙古蒙古族青年合唱团是目前中国唯一的具有业余性质、用蒙古语演唱、以蒙古族创作歌曲和民歌为主的、获得很高国际声誉的少数民族合唱团。