博物馆的馆址，原是一座清代公主的府邸，当地群众习称“公主府”。公主府建于清代康熙年间，是康熙皇帝之女恪靖公主与清代蒙古喀尔喀部土谢图汗之孙敦多布多尔济联姻时所建。公主府以其精美的古代建筑艺术和优美的民间传说而闻名于世。

据记载，公主府的主人恪靖公主，是康熙皇帝的六女儿，生于清康熙十八年（1679年），卒于雍正十三年（1735年），终年57岁。这位公主曾三次受封，先后被封为“和硕公主”、“恪靖公主”、“固伦恪靖公主”，而民间则称她为“海蚌公主”。清康熙三十六年（1697年），公主下嫁给蒙古喀尔喀部土谢图汗察珲多尔济的孙子敦多布多尔济为妻。当时，因北方一带战事频繁，只好缓行。公主离开京城后，曾先后在今清水河县长城边的口子上村和黄河岸边的岔河口一带暂居，后搬到清水营（今清水河县城关镇）居住，并修建了公主花园作为府邸，居住时间长达9年。康熙四十五年后，又由清水河移居归化城（今呼和浩特市旧城）札达盖河北岸居住。此时，北方战乱仍然未停，于是，清廷在归化城北2500米处圈地约20万平方米，大兴土木，专门为公主修建了一处规模宏大的公主府邸，定居下来。

公主府是按照清代皇族品级营造的，体现了清代皇家府邸特有的建筑形式。整个建筑豪华威严，布局严谨。建筑由南向北，层层递进，严格采用了中轴控制、突出主体、左右均衡的建筑布局。府门前设广场，正南建有青砖照壁。府门高大雄伟，门前立汉白玉石狮一对。东西两侧设有便门，可入东西跨院。正门向里依次建有前殿、大殿、寝殿三重大殿及左右配殿和东西厢房等，构成四重院落，加上东西跨院，共为六院。院与院之间，有仪门、垂花门、满月门相通。主体东部为花园区，建有假山、鱼湖、凉亭等。西部为马场、住宅区，曾有白塔一座，现已无存。

公主府的建筑不仅巍峨壮观，而且结构精巧，用料考究。每座殿堂的基座皆由洁白的大理石镶边包砌，墙体均为棱角分明的水磨青砖砌成，墙面严丝合缝，粉刷后形如墨玉，故被民间誉为“一块玉”。柁檩一律采用四棱方木，独具特色。据说，府内的殿宇基础都是先经掘地三尺，回填白灰、沙子、粘土合拌的三合土后，再由人工夯实而成。

公主府既有体量宏大，形式规整的宫廷式建筑，又有小巧玲珑，形式多变的园林式建筑。两者紧密结合，相互呼应，在空间上连为一体，在景观上互为映衬，收到了相得益彰的艺术效果。

呼和浩特市是中国著名的历史文化名城之一，也是我国历史上北方地区重要的政治、经济、文化中心。历史上汉族与匈奴、鲜卑、突厥、契丹、蒙古、满等民族相继在此生息共处。他们在这里开拓边疆，兴建城池，发展经济，共同创造了绚丽多彩的物质文明和精神文明，成为中华民族发展史上一个重要的组成部分。呼和浩特市有着悠久的历史和文化，地上、地下的文化遗存极为丰富。

呼和浩特市博物馆，是一座集收藏、研究、展览于一体的博物馆。主要以收藏和展出呼和浩特地区的文物为主。博物馆收藏的文物中，既有保留着中原汉文化特点的历史文物，也有表现出北方少数民族文化特点的民族文物。同时，还有一部分是近现代以来的民俗文物和革命文物。大量的文物从不同的侧面反映、证实了呼和浩特地区悠久灿烂的历史文化。

该馆的馆藏文物丰富多彩，有远古时期的肿骨鹿、野牛角化石，有石器时代的尖状器、刮削器、石斧、石刀等石器工具；有商周到战国时期的三足瓮、彩陶罐、青铜戈、青铜刀和布币、刀币等各种钱币；有汉代的铜鼎、铜镜、铜钱、带钩、薰炉、饰牌、瓦当、钱范、陶釜、陶罐、铁锄、犁铧等；有魏晋、隋唐时期的铁剑、金饰牌、金币、鎏金马具、石佛经幢等；有辽金元时期的菩萨头像、三彩香炉、剔花大罐、玉壶春瓶、搅胎碗、高足杯、陶棺、墓志、铜印、纸币等；有明清时期的铜火铳、铁甲衣、金铜造像、召庙壁画、石雕碑刻，以及近现代以来蒙、满、回等少数民族使用过的生产工具、生活用具等各种器物。其中珍贵的文物有：距今50万年以前人类制造的石器工具“龟背形刮削器”；商周时期的“三足瓮”，战国时期的“刀币”、“布币”、“青铜戈”；秦汉时期的“错金银铜带钩”、“合金青铜镜”；北魏的“双羊五轮金饰牌”；隋唐的“罗马金币”、“鎏金铜马蹬”；辽代的“菩萨头像”；金代的“描金玉壶春瓶”；元代的“中统元宝交钞”；明代的“连环锁子铁甲衣”；清代的“鎏金铜佛像”等。其中，双羊五轮金饰牌和中统元宝交钞，更是极为珍贵和不可多得的历史文物。

双羊五轮金饰牌，出土于呼和浩特市东郊太平庄乡添密梁村。饰牌为纯金制成，重90克，呈长方形，长9.5厘米，宽7厘米。饰牌设有边框，框内为镂空透雕的双羊和五轮图案。双羊对称站立，双羊中间有竖立的三只轮子，双羊腹下又各跨一只轮子，五轮形似车轮。双羊造型优美，体健、颈挺，腿修长而微曲。头部呈三角形，圆眼、长吻，羊角硕大，呈弯月状弧形。整个造型俊美、精巧。该饰牌具有鲜明的地域特色，图案中的双羊反映了浓厚的草原气息。其双羊是以生活中的羊为原型，运用了夸张的艺术手法，从而制造出一种艺术化了的和代表吉祥的“神羊”图案。饰牌中的五只轮子，既是当时北方游牧民族生活中的真实写照，也是现实生活在艺术上的美好体现。该饰牌，是呼和浩特地区众多饰牌中最为精美和价值最高的一件金饰牌。

中统元宝交钞，出土于呼和浩特市丰州古城遗址的万部华严经塔内。交钞为丝绵质纸币，木版印刷而成。纸币面值为壹拾文。纸币正面文字较多，顶端横书“中统元宝交钞”钞名，以下用花纹作框，分出上下版面。上版标有“壹拾文”钞额面值和十枚铜钱图案，以及汉篆“中统元宝，诸路通行”八字。下版印有“伪造者斩赏银五锭仍给犯人家产”，“行中书省奏准印造中统元宝交钞”等文字，共计84字。纸币背面文字较少，仅有“壹拾文”钞额和十枚铜钱图案。纸币正背两面分别盖有“提举诸路通行宝钞印”、“宝钞总库之印”和“印造元宝交钞”朱印各一方。经考证，该纸币是我国元代早期发行的一张纸币。也是目前世界上迄今为止发现的最早的一张纸币实物，具有极高的历史价值和科研价值。

呼和浩特市博物馆自建馆以来，曾先后举办了《历史文化名城呼和浩特》、《召庙壁画艺术》、《呼和浩特蒙古族民俗》、《呼和浩特满族民俗》、《呼和浩特回族民俗》、《呼和浩特民间剪纸艺术》等专题和系列展览。并先后引进和承办了《青年时代的周恩来》、《中国古代科技成果》、《杨鲁安文物珍藏》等各种展览。