满清贵族入关前信奉藏传佛教格鲁派，入关后重在利用理学治世。起初对道教采取笼络的态度，顺治帝曾召江西龙虎山正一道第52代天师张应入朝，赐一品印，令掌管天下道教。乾隆帝宣布黄教为国教，贬抑正一道教，将“天师”由正一品降为正五品，并规定天师不能直接朝觐皇帝，只能由礼部引见
。道光帝时取消正一真人号，禁止天师入宫，使道教的社会影响日渐低落。而作为明代道教中心的武当山大约也是从此开始衰落下去的。
不过，全真道在北方少数民族中颇有影响，因此，从清初顺治帝起，对全真道受戒传度大开绿灯。康熙帝曾褒封全真中兴主将王常月，康熙九年(1669年)，王常月率詹守椿、邵守善等门徒南下，于南京、杭州、湖州、武当山等地立坛受戒，南人皈依者众。王常月卒后，康熙帝敕赠“抱一高士”，每年忌日遣官致祭。
但是，全真诸派中呈中兴之象者唯有龙门派，以全真龙门派为主体的内丹道教，经清初的中兴，一度呈现复兴全真初期教风之象，重戒行、真功的实践，道士中颇有隐栖苦修、炼养有素而以高寿、气功、异能著称者，除王常月之外，还出现了陶靖庵、周明阳、范青云、高东篱、沈轻云等一批有影响的高道。至清末，全真一系的势力仍相当强大，宫观庵院遍布各地，田产收入亦相当雄厚。武昌长春观，“着屋千间，道友万数”(《长春观志》卷一)，与西安八仙庵、成都二仙庵等并称天下龙门派大丛林。
尽管有全真龙门派的中兴，但总的来说，道教在清代已相当衰落，尤其是在上层人物中几乎没有什么影响。而且清代的宫观建设相当少，道教理论研究更是微乎其微。
虽然清代道教在上层人物中少有影响，但在民间却甚活跃，而且作为一种发动人民的工具——会道门也应运而生。这种带有宗教和封建迷信色彩的民间秘密结社虽一直被清统治者取缔，但始终不能奏效。在清中后期的多次农民起义中，会道门都起着相当重要的作用，其中在荆楚地区有影响的主要有收元教、混元教、西天乘教、青莲教、灯花教、江南斋教、归根道等，其中又以青莲教的影响最大。
内容把关：白嘎达
