哈尼族认为，人和万物都由灵魂或精灵主宰。一旦灵魂失落，或触犯精灵，人就会得病甚至死亡。有人生病，就要为他叫魂，叫魂是让病人康复的有效办法。叫魂有一套专门的仪式：用一根线，一个饭团，一个鸡蛋到病人失魂落魄的
地方，高声呼唤病人的名字，做出各种招魂的动作，然后回到病人身边，将线拴在他的手腕上，给病人吃下招魂的饭团与鸡蛋，于是失落的魂魄就回到身体里，病人自然就痊愈了。如果叫魂无效，就是专门捉魂的精灵“拉帕”作祟。得请众人，手持刀枪，鸣枪哄赶拉帕。拉帕逃走，魂归身体，病人就康复了。
未婚或已婚无嗣者，死后一埋了事。已婚而只生女性者，葬礼也比较简单。非正常死亡者，视为不吉，不得葬于公共墓地，不得祭祀。对于有子女或多子多孙者实行厚葬。一般在家中停放三五天，以至7天，出殡时要杀牛宰羊祭奠，请巫师念经祈祷，送魂，祝福他的灵魂返回祖先故地。葬后12天，请巫师杀鸡两只，杀猪一口，置于竹桌，由死者家属抬到通往坟地的岔路口，请巫师为生者叫魂。然后抬竹桌归家，置于祖先灵台前。家人坐于竹桌周围，巫师用桌上的线拴在每个人的手腕上，表示生人的魂已叫回来拴在各人的手上，附在身体里。
村寨祭祀是哈尼族宗教的重要内容。村寨祭祀有建寨、分寨和定期祭祀三类。建立村寨时，十分重视寨址的选择。由祭司选定寨址后，祭司择吉日卜选寨心。祭司在新寨址向四方抛洒铁渣，再向空中抛鸡蛋，以鸡蛋着地破裂的地方为寨心，立木桩为记，寨心为祭司居住地。祭司率领全村男女老少在同一天搬到新寨址，搭起临时窝棚暂住。大家先帮祭司盖起新房，然后再建造各自的房屋。寨心是全村集会的中心。村寨每年要立一次新寨门，新寨门落成，举行寨门祭。祈求神灵保佑全寨。寨门有三道：前门、后门和侧门。前门和侧门供人出入，后门是尸体的出口。每年九月，祭司率领全村男子，手持木刀，在室内室外、房前屋后、寨子各处驱赶鬼怪。最后，将木刀悬挂于寨门上。赶走的鬼怪见到木刀就不敢再进寨子兴风作浪。
哈尼族以农业生产为主，农业生产的每一个阶段和所有领域都有祭祀活动。
哈尼族以大树为土地神。因为树木高大挺拔，显示了无限的生机和旺盛的活力。从树木的繁枝茂叶可以看出土地滋养生物的神奇力量。每个村子的寨头寨尾都供奉“神树”。村头的神树叫“阿妈周”(公树)，寨尾的神树叫“本土周”(母树)。正月大祭公树，三月小祭母树。
哈尼族十分敬重水井之神，时常有祭司主持在井边设台祭祀，奉上米、酒、茶各两碗，公鸡、母鸡各一只，祈求神灵保护井水清洁充沛，水源不断，稻谷丰收。哈尼族认为田沟的水神是粮食丰收的保证，祭品比较丰厚，除一般的供品外还要加两只羊。有些哈尼族村寨每逢龙年(12年一次)举行一次“大楼都”大祭。“楼都”是寨心的大井。届时全村集体杀猪宰羊，隆重祭祀。祭品分食后，将骨头扔进井中，企盼人畜兴旺、五谷丰登。
“播种祭”和“收获祭”，是农耕民族都十分重视的祭祀。西双版纳哈尼族称播种祭为“牙卡培楼”。在每年正式播种前两天，由祭司主持。第一天，祭司以酒、茶、年糕等祭祀祖先。第二天清晨，祭司和村寨的长者在神井前举行清洗谷种仪式，用公鸡、母鸡各一只，米一筒，酒一筒，茶叶一把，稻谷三把供祭。祭司在稻田里播下三把稻种后，就地分食祭品，接着各户人家在临时搭成的棚屋中举行庄重的播种仪式。栽种水稻的金平哈尼族祭祀有专供祭祀的水田，在播种时，以猪肉祭祀谷神。在插秧时杀鸡祭祀水田。由老年妇女在祭田的中央载插第一丛秧苗，各家各户跟着插秧。每户人家也有自己的小块祭祀田，插秧必须先从祭祀田开始。
收获祭祀包括尝新、收割、入仓的祭祀。稻谷成熟时，举行尝新祭祀。尝新祭要用在播种祭祀用的棚屋附近的稻谷，同时以鸡、酒、茶以及即将收获的瓜、果、蔬菜祭祀祖先，还要取回三穗稻谷供在祖先的灵台前。收割前，以酒、茶、饭、蛋为祭品，举行收割祭祀，然后开镰收割。收割完毕，必须将最后收割的一把稻谷挂在谷仓的大梁上。入仓前用糯米饭、鸡蛋、茶、米酒祭祀谷仓。接着举行入仓仪式。装稻谷进仓的背篓下垫9片树叶，上覆以品行端正受人尊敬的男子汉的上衣。由男子背着三进三出谷仓后正式装仓。开仓取谷时，也有开仓仪式，由家长身负背篓三进三出，第三次背稻谷出仓时，要抓三把稻谷还仓。以后每次进仓取谷都必须抓三把谷子放回仓中，以示年年有余。
祭司主持公共祭祀。西双版纳哈尼族的祭司为世袭制。除非祭司家的孩子出现六指、兔唇、双胞胎等“不吉利”的象征时，才会替换。祭司移居，整个村子也要跟随搬迁。否则，撤除寨门，另选祭司。村寨里的人杀猪宰牛或捕获猎物时，都要给祭司献上一条兽腿。金平、元阳等地的祭司称为“厄阿玛”，由全村卜选产生，终身制，一般不得世袭。
巫师有专司葬礼和送魂的“贝牟”和驱鬼治病的“尼帕”两种。“贝牟”由男子担任，要拜老贝牟为师，学习祭祀故事，体验祭祀生活，实践祭祀礼仪。“尼帕”不论男女均可担任。少数人是在拜师学习后担任“尼帕”的，更多的是在本人患病时被尼帕指为有尼帕鬼附身，并经许愿发誓，在病愈后供奉尼帕鬼，摇身一变成为尼帕。
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