虽然佛教和基督教已传入佤族地区，但未能取代本民族固有的宗教信仰。
佤族每年的祭祀活动大都以祭水神为开端。祭水神通常全村男子集体参加。祭司将
新年接来的第一筒水置于神龛，虔诚祈祷，求神保佑水源不断，风调雨顺，五谷丰登。然后用这筒新水在祭司家煮饭。接着各家各户分别举行祭祀，祈求清泉长流不断，人畜天天有水喝，庄稼不缺水。祭祀火神也是新年开始的重要宗教活动。新年伊始，全村人聚集在一起，由村长主持祭祀火神的仪式，以米、酒、盐、菜、肉、火灰等为祭品，隆重祭祀火神，祈求新年万事如意，然后用竹片与火草摩擦出“新火”，各家用火把将新火带回家重新点燃火塘。
佤族认为“梅吉”是主宰万事万物的神灵，时时都要顶礼膜拜。逢年过节要祭祀“梅吉”，祭祀时要杀猪一头，杀鸡数只。如遇到天灾人祸，就要以村寨为单位举行大祭。
木鼓是佤族最重要的法器。佤族认为木鼓是与神相通的媒介，是庇护氏族的神灵，传递信息的工具，鼓舞斗志的号角。所以，佤族十分崇拜木鼓。制作木鼓时要举行隆重的宗教仪式。请祭司到深山选定制作木鼓的神树。选定吉日伐木。伐木前祭祀山神与树神，在树前对空鸣枪两响，惊走树魂。将树砍倒后，男子前拉后推，祭司与村长在前后呐喊助威，大家齐心合力把树拉回村寨。制作木鼓前要举行隆重的祭祀。祭司剽牛诵经，大家分食祭天的牛肉，在剽牛地唱歌跳舞。夜幕降临，燃起篝火，男女老幼彻夜歌舞狂欢，通宵达旦。木鼓每次制作一对，雌雄各一只。雄鼓小，雌鼓大。木鼓内腔大小宽窄深浅不一，可以敲击出不同声响。木鼓制好后，放在村子的神树下供奉，有的还搭盖木鼓房，成为村中最神圣的地方。氏族成员以木鼓为中心环居周围，求得神灵的保佑。平时任何人不能轻易触动木鼓。祭祀、集会、欢庆、婚嫁、丧葬、报警、战斗等大事都要敲击木鼓。不同的活动有不同的声响和节奏。
西盟佤族在20世纪50年代以前有“猎头祭谷”的宗教习俗。为祈求丰收和人畜平安，西盟佤族每年秋冬要猎取有血仇的氏族或村寨的人头祭祀。首先请祭司占卜，确定猎头的组织者与指挥者。猎到人头后，将人头置于木鼓房的人头桩上，在人头上抛撒火灰，火灰与人血混合落到地面，将血灰平均分配给各户人家，在播种时与种子一起撒到田地里，认为可以得到丰收。猎到的人头既是祭祀神灵的供品，又是祈求丰收和平安的崇拜对象，形成特定的祭头仪式。祭头仪式分集体和家庭两种方式。集体祭祀以部落为单位。在猎到人头后，先在建寨最早的老寨供祭，然后轮流在各寨祭祀，最后回到老寨供奉。家庭祭祀一般在太阳偏西时举行。先到祭司家由祭司从祭祀人头的台上取下人头，交给两个未婚妇女抬至木鼓房。一路上，猎头者在前面走，家人紧随其后，沿途鸣枪击鼓。到木鼓房后，将人头放在祭祀台上，向人头撒米，祈求赐福禳灾。然后抬着人头绕木鼓房转九圈，边转边跳边唱，再从原路将人头抬回祭司家，转交另一家人祭祀。各家各户祭祀完毕，再抬回木鼓房，由祭司将人头放回供人头的竹架上。集体祭祀要剽牛杀猪供献。家庭祭祀也要以猪、鸡为祭品供祭。每年农历四五月播种前后，还要举行送头仪式。由祭司和老人将上次猎获的人头骨送到村外林间的人头桩上置放。安放人头骨也要祭祀，鸣枪、跳舞、唱歌，供献祭品。自1950年以后，云南佤族的猎头血祭已完全绝迹。
佤族的祭司多由酋长担任，一般每个氏族两人，一个管木鼓，一个管水。管木鼓的地位高于管水的。管木鼓的祭司每年至少举行两次木鼓祭，一是拉木鼓，即伐木、拉树、制作木鼓；一是盖木鼓房。管水的祭司负责主持村寨集体的祭水仪式，祈求水源长流不断。每家每户祭水时也请他主持祭祀。祭司通常是世袭，由长子继承。无子由养子、兄弟、族人继任。祭司的地位特殊，居住大屋，屋脊两端有木刻的燕子，并有木刻的裸体男子雕像。盖房子的仪式十分隆重，全村来帮忙，剽牛祭祀。落成后，用牛、石灰、木炭等在四壁绘上各种神鬼图画。
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