清代云南史学发展最大的特点是各府、州、县及各地修志热情高涨，各具地方特色、内容详实的府、州、县志大量涌现，极大地繁荣了云南史学。仅粗略统计，有康熙《云南府志》、康熙《大理府志》、雍正《临安府志》、嘉庆《临安府志》、康熙《澄江府志》、道光《澄江
府志》、乾隆《广南府志略》、道光《广南府志》、康熙《顺宁府志》、雍正《顺宁府志》、雍正《顺宁府志》、光绪《续修顺宁府志》、康熙《曲靖府志》、乾隆《丽江府志略》、光绪《丽江府志》、康熙《鹤庆府志》、道光《普洱府志》、光绪《普洱府志稿》、康熙《永昌府志》、乾隆《永昌府志》、光绪《永昌府志》、乾隆《开化府志》、道光《开化府志》、雍正《东川府志》、乾隆《东川府志》、光绪《东川府续志》、乾隆《镇雄府志》、光绪《镇雄府志》、康熙《广系府志》、乾隆《光绪府志》、康熙《元江府志》、雍正《景东府志》、乾隆《景东直隶厅志》、康熙《蒙化府志》、乾隆《续修蒙化直隶厅志》、乾隆《永北府志》等36部府志，很多府不只一部府志，有的一府竟有二三部府志。还有《晋宁州志》、《昆明县志》这样的州县志书多达132部，甚至一些对云南经济至关重要的盐矿井也立了专志，整个清代云南府州县志的修纂在二百余种以上。特别是在康熙、乾隆、雍正年间，云南社会经济稳定，文化发展，掀起了“盛世修史”的高潮，故这一时期各地所修府、州、县志特别多。清代官修志书的成就还体现在府、州、县志的修纂更为普遍，已经不像明代那样，府、州、县志的撰修只集中在社会经济发达、文化比较繁荣或文化中心的几个府县，而在清代修志遍及云南各个地方行政区划，几乎清代云南所有的府、州、县都曾修过志书，有的甚至不止一次修志。除官修外，清代私人编修的府、州、县志的情况也很普遍，成为云南文化发展的突出特征。据不完全统计，清代云南已设治而没有现存志书的只有富州、中甸厅、维西厅、思茅厅、他郎厅、安平厅、大关厅、鲁甸厅等，除此之外大多数地方至少有一部志书，多者的有五部，这些府州县志构成清代云南史学的一个重要组成部分。
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